Prva in najpomembnejša faza zdravljenja parodontozeje oralno-higienska faza, med katero se pacient nauči postopkov pravilne ustne higiene, odstrani mehanične ovire za čiščenje (zobni kamen, previse plomb in umetnih zobnih kron) ter odstrani bakterijski biofilm iz obzobnih žepov (postopek luščenja in glajenja korenin).
Če je potrebno sledi oralno-higienski fazi tudi kirurški poseg, med katerim se dlesen odmakne od zobne korenine, s površine korenine mehanično očisti biofilm bakterij, zobni kamen in nekrotični del cementa, obzobni žep pa nekoliko zmanjša. Tudi po kirurškem zdravljenju je potrebno redno odstranjevanje bakterijskega biofilma iz obzobnih žepov v trimesečnih ali v polletnih intervalih pri zobozdravniku.
Kirurškemu posegu nato sledi vzdrževalno zdravljenje, ki je doživljenjsko. Pomembni so redni obiski pri zobozdravniku (na tri do šest mesecev), kjer se spremlja globina obzobnih žepov in preprečuje nastanek ponovnih vnetij.